本階段開放接種對象包括：流感疫苗為50至64歲無高風險慢性病成人及JN.1新冠疫苗為出生滿6個月以上之民眾(未列於第一階段者)。今(113)年度流感及JN.1新冠疫苗同步分階段施打，為提高疫苗接種率，疾管署再度與全聯福利中心(下稱全聯)及各縣市衛生局攜手合作，於全聯及大潤發指定門市設置接種站，方便民眾就近施打疫苗。
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